北京公司申请京牌的具体流程大致如下：

1. 资格审核：首先，公司需要满足一定的条件，比如具有统一社会信用代码的有效营业执照，并且根据上一年度在本市缴纳的增值税额度或固定资产投资额来确定可以申请的小客车指标数量 。

2. 获取指标：符合条件的企业可以通过北京市小客车指标调控管理信息系统进行指标申请，系统网址为 https://xkczb.jtw.beijing.gov.cn/

3. 准备材料：准备相关的申请材料，包括但不限于营业执照、税务登记证、组织机构代码证、法人身份证明、委托书等。

4. 注册登记：拿到小客车指标后，公司需要到北京市公安局公安交通管理局车辆管理所进行机动车的注册登记 。

5. 提交材料：提交法律法规规定的申请材料，包括机动车所有人身份证明、机动车来历证明、交通事故责任强制保险凭证等 。

6. 办理时限：注册登记的办理时限一般为国产机动车1个工作日、进口机动车2个工作日 。

7. 缴费：根据规定缴纳相关费用，包括汽车反光号牌费、机动车行驶证费、机动车登记证书费等 。

8. 领取临时号牌和证件：在办理完注册登记并缴费后，领取临时号牌、《机动车行驶证》和《机动车登记证书》 。

请注意，具体的办理流程和所需材料可能会随政策变化而有所不同，建议在办理前访问北京市小客车指标调控管理信息系统或联系相关部门获取最新的办理指南和要求。