京A车牌的持有者在历史上确实拥有一些特权，但随着政策的变化，这些特权已经有所减少或改变。以下是一些京A车牌持有者曾经拥有的特权：

1. 特殊公务用途：京A车牌主要用于政府机关的公务用车，包括机要通信用车、应急保障用车、离退休干部服务用车和调研用车等.这些车辆在执行紧急公务、参加重大公务活动等特殊情况下可以统筹使用。

2. 路权优势：对于京A摩托车牌照，持有者在北京市四环内享有高度自由的路权，除少数限行道路外均可畅行，而京B牌照则受到更多限制.

3. 特殊通行权利：在某些特殊情况下，京A车牌车辆，尤其是带有警备牌证或其他特殊通行牌证的车辆，可以行使一定的特殊通行权利，比如在紧急公务处理时.

4. 政策优惠：京AG6开头的车牌属于副国级专用，享有一些政策优惠，如免除交强险、环保证、年检等.

5. 特殊出入证：持有京AG6车牌的车辆在全国范围内可以享受高级出入证的待遇，全国放行.

需要注意的是，随着公车改革和政策的调整，许多特权已经不复存在或受到严格限制。现在，京A车牌更多地被视为一种身份的象征，而不是特权的代表。同时，对于公务用车的管理也越来越严格，确保公车用于正当的公务活动