公司转让车牌时需要进行的税务处理主要包括以下几个方面：

1. 增值税处理：

   • 如果公司是增值税一般纳税人，并且在购入车辆时没有抵扣进项税额，那么在转让车辆时，需要在增值税申报表附表一中将车辆销售额填入按3%简易征收的栏次计算销项税额，并在主表中按3%计算销项税额。同时，在应纳税额减征额填写1%的那一部分税额，并在减免税申报明细表减税性质代码及名称选择对应的已使用固定资产减征增值税财税政策，并填写减税发生额。
   • 如果公司在购入车辆时已抵扣过进项税，则需要按照13%的税率填写销项税额，并在主表中同样按照13%计算销项税额。

2. 开具发票：

   • 二手车所有人不通过经销公司将车辆直接出售给买方的，应当由税务机关或二手车交易市场按规定向买方开具税务机关监制统一发票。企业自行开具的增值税发票记账联原件、发票联复印件及相关过户资料，由二手车交易市场开具《二手车销售统一发票》。

3. 账务处理：

   • 在处置资产时，会计分录为：借记“固定资产清理”和“累计折旧”，贷记“固定资产”。
   • 收到转让车辆款项时，会计分录为：借记“银行存款”，贷记“固定资产清理”和“应交税费--应交增值税（销项税额）”。
   • 结转处置资产损失或收益时，会计分录为：借记“固定资产清理”，贷记“营业外收入”或借记“营业外支出”，贷记“固定资产清理”。

4. 所得税处理：

   • 销售汽车的同时需要确认收入，进行所得税的申报和缴纳。

5. 印花税处理：

   • 根据《中华人民共和国印花税法》，汽车卖给个人免印花税。动产买卖合同中如果书立人中有个人的，则该合同不属于征税范围，不缴纳印花税。

6. 车辆购置税处理：

   • 根据当地税法规定，可能需要进行车辆购置税的缴纳或退还处理。

7. 公司信息更新：

   • 完成车辆转让后，需要在工商部门进行公司信息的变更登记，确保公司的车辆信息与实际情况一致。

以上是公司转让车牌时需要进行的主要税务处理流程，具体操作时还需根据当地税务机关的具体要求和规定执行。